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Explorando microbioma intestinal usando herramientas computacionales investigadores identifican 2 mil nuevas especies de bacterias intestinales

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El intestino humano es el hogar de muchas especies de microbios, denominados colectivamente como microbiota intestinal. A pesar de los extensos estudios en el campo, los investigadores todavía están trabajando en la identificación de las especies microbianas individuales que viven en nuestros interiores y en la comprensión del papel que desempeñan en la salud humana.

Los autores del estudio solicitan más datos de América del Sur, África y Asia, para lograr un plan más completo del intestino humano.

Los autores del estudio solicitan más datos de América del Sur, África y Asia, para lograr un mapa más completo del intestino humano.

Investigadores del Instituto Europeo de Bioinformática y del Instituto Wellcome Sanger han identificado casi 2 mil especies de bacterias que viven en el intestino humano. Estas especies aún no han sido cultivadas en el laboratorio. El equipo utilizó una variedad de métodos computacionales para analizar muestras de individuos de todo el mundo.

Los resultados, publicados en la revista Nature 1, destacan que aunque los investigadores posiblemente estén más cerca de crear una lista completa de los microbios que se encuentran comúnmente en el intestino de América del Norte y Europa, existe una falta significativa de datos de otras regiones del mundo.

Reconstruyendo” bacterias

Hay muchas razones por las cuales algunas especies microbianas que forman parte de la microbiota intestinal han permanecido desconocidas durante tanto tiempo, como una baja abundancia en el intestino o la incapacidad de sobrevivir fuera de él. Mediante el uso de métodos computacionales, los investigadores pudieron reconstruir los genomas de estas bacterias.

Los métodos computacionales nos permiten entender las bacterias que aún no podemos cultivar en el laboratorio. El uso de metagenómica para reconstruir genomas bacterianos es algo así como reconstruir cientos de rompecabezas después de mezclar todas las piezas juntas, sin saber qué aspecto tiene la imagen final, y después de eliminar por completo algunas piezas de la mezcla solo para que sea un poco más difícil“, dice Rob Finn, Líder de Grupo en EMBL-EBI. “Los investigadores se encuentran ahora en una etapa en la que pueden usar una variedad de herramientas computacionales para complementar y, a veces, guiar el trabajo de laboratorio, a fin de descubrir nuevos conocimientos sobre el intestino humano“.

Diversidad geografica

La investigación destacó cómo la composición de las bacterias intestinales difiere en todo el mundo y la importancia que tienen las muestras que estudiamos para reflejar esta diversidad.

Estamos viendo que muchas de las mismas especies bacterianas surgen en los datos de las poblaciones europeas y norteamericanas“, continúa Finn. “Sin embargo, los pocos conjuntos de datos sudamericanos y africanos a los que tuvimos acceso para este estudio revelaron una diversidad significativa que no está presente en las poblaciones anteriores. Esto sugiere que la recopilación de datos de poblaciones con representación insuficiente es esencial si queremos lograr un panorama verdaderamente completo de la composición del intestino humano“.

Plano de la tripa humana

Los métodos computacionales nos permiten tener una idea de las muchas especies bacterianas que viven en el intestino humano, cómo evolucionaron y qué tipo de roles pueden desempeñar dentro de su comunidad microbiana“, dice Alexandre Almeida, miembro postdoctoral en EMBL-EBI y Wellcome Sanger Institute. “En este estudio, aprovechamos las bases de datos públicas más completas de bacterias gastrointestinales para identificar especies bacterianas que no se han visto antes. Los métodos de análisis que utilizamos son altamente reproducibles y se pueden aplicar a conjuntos de datos más grandes y diversos en el futuro, lo que permite más descubrimiento“.

Investigaciones como esta nos están ayudando a crear un mapa del intestino humano, que en el futuro podría ayudarnos a comprender mejor la salud y la enfermedad humana e incluso podría guiar el diagnóstico y el tratamiento de enfermedades gastrointestinales“, concluye Trevor Lawley, líder del grupo. en el Instituto Wellcome Sanger.

Referencias

  1. ,,,,,,; A new genomic blueprint of the human gut microbiota; Nature; 2019; Fecha de publicación 11/02/2019; DOI: 10.1038/s41586-019-0965-1; Disponible en el URL : ; Consultado el 11/02/2019
Crédito de la imagen Spencer Phillips | EMBL-EBI

Autor
Plenilunia Salud Mujer
Plenilunia Salud Mujer

Redacción, Plenilunia Sociedad Civil Fundada en el año de 2004, Plenilunia es una Sociedad Civil cuyo objetivo es fomentar el bienestar y la salud integral de la mujer.

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